Ključna razlika: domača aplikacija je aplikacija, ki je posebej razvita za mobilni sistem. Izvorne aplikacije so razvite z uporabo platforme SDK, orodij in jezikov za določeno platformo. Hibridna aplikacija v drugi aplikaciji je aplikacija, ki je razvita s spletnim jezikom, kot sta HTML 5, CSS in JavaScript. Te aplikacije se nato zaženejo v naravni vsebnik, kar jim omogoča zagon v katerem koli mobilnem sistemu.

Aplikacija, kratka za aplikacijo, je program ali skupina programov, ki se lahko uporabljajo za določen namen. Čeprav je vsa programska oprema, ki jo uporabljamo, tehnično uporabna, se izraz »aplikacija« običajno uporablja v okviru aplikacij, ki se uporabljajo v mobilnih sistemih, kot so Android, iOS, Windows Mobile, Blackberry itd.

Obstajata dve glavni vrsti aplikacij: domača aplikacija in hibridna aplikacija. Aplikacija z vidika uporabnika je lahko identična; vendar so dejanske razlike med aplikacijami le v sistemih, v katerih so razvite.

Izvorna aplikacija je aplikacija, ki je posebej razvita za mobilni sistem. Na primer: aplikacija, ki je razvita za iOS. Ta aplikacija ne bi bila ustrezno združljiva z drugimi mobilnimi sistemi, kot je Android. Da bi aplikacija delovala na Androidu, mora biti aplikacija ponovno razvita v okviru Androida.

Izvorne aplikacije so razvite z uporabo platforme SDK, orodij in jezikov za določeno platformo. Za Android je treba izvirne aplikacije razviti z uporabo programa Eclipse ali Java. iOS uporablja xCode in Objective-C za razvoj svojih aplikacij, medtem ko Windows Phone uporablja Visual Studio in C #.

Hibridna aplikacija v drugi aplikaciji je aplikacija, ki je razvita s spletnim jezikom, kot sta HTML 5, CSS in JavaScript. Te aplikacije se nato zaženejo v naravni vsebnik, kar jim omogoča zagon v katerem koli mobilnem sistemu. Na primer: za zagon v Androidu lahko aplikacijo poganjate v originalnem vsebniku za Android, aplikacijo pa lahko premaknete v domači vsebnik za iOS, da bo lahko deloval v sistemu iOS.

Prednost hibridne aplikacije je, da prihrani čas in energijo. Aplikacijo je treba razviti samo enkrat, nato pa jo lahko prenesete v kateri koli sistem. Ker mora biti domača aplikacija razvita za vsak sistem posebej. Vendar ima native aplikacija boljši uporabniški vmesnik, kot je bil razvit posebej za ta sistem. Prav tako ima boljšo združljivost z manjšimi možnostmi, da nekateri deli aplikacije ne uspejo.

Obe domači aplikaciji in hibridne aplikacije se prenesejo iz shrambe aplikacij platforme in shranijo ter izvajajo v napravi. Vendar pa hibridne aplikacije vzpodbudijo mehanizem brskalnika naprave, da prikaže HTML in lokalno obdeluje JavaScript. Da bi razvil domače aplikacije za različne platforme, mora razvijalec poznati različne jezike, za razvoj hibridne aplikacije pa mora poznati samo enega.

Vsaka od različnih vrst aplikacij ima svoje prednosti. Zato so nekatere aplikacije bolje razvite kot domače aplikacije, zlasti igre in druge aplikacije, ki zahtevajo boljšo in hitrejšo učinkovitost, grafiko itd. Vendar pa lahko za druge aplikacije hibrid deluje bolje, na primer za aplikacije, ki morajo prikazovati spletne strani, zemljevide itd. .

Primerjava med domačo in hibridno aplikacijo:

	Native App	Hibridna aplikacija
Opis	Aplikacija, ki je posebej razvita za platformo, ki uporablja SDK platforme, orodja in jezike.	Ena aplikacija, kodirana z uporabo spletnega jezika, ki se lahko prenese na katero koli platformo pod običajnim vsebnikom.
Zaženi	Naprava	Naprava
Razvoj jezika	Razvito z uporabo platforme SDK, orodij in jezikov za določeno platformo. Za Android je treba izvirne aplikacije razviti z uporabo programa Eclipse ali Java. iOS uporablja xCode in Objective-C za razvoj svojih aplikacij, medtem ko Windows Phone uporablja Visual Studio in C #.	Razvit s spletnim jezikom, kot sta HTML 5, CSS in JavaScript.
Zapletenost	Bolj zapleteno kodiranje	Manj zapleteno kodiranje
Uporabniška izkušnja	Boljša uporabniška izkušnja	Manj uporabniške izkušnje kot domačih aplikacij
Izvedba	Hitrejše in boljše delovanje	Počasnejša zmogljivost kot domače aplikacije
Grafika	Boljša grafika	Manjše grafike kot domače aplikacije
Prenosljivost	Težje je povezati druge sisteme	Lažje je do drugih sistemov
Integracija	Kamera, adresar, geolokacija in druge funkcije, ki so izvirne za napravo, se lahko brez težav integrirajo v izvirne aplikacije.	Nekatere funkcije naprave je morda težje vključiti v hibridne aplikacije.
Naložbe	Potrebujete več naložb, ker so napisane z bolj kompleksnimi jeziki, načrti in strukturami.	Potrebujete manj naložb