Ključna razlika: koagulacija pomeni skrčiti; v bistvu se nanaša na kemijski proces, v katerem pride do destabilizacije delcev, ki jih ni mogoče poravnati. Ti delci tvorijo grudice s pomočjo koagulanta. Po drugi strani pa flokulacija pomeni oblikovanje kosmičev. Lahko ga opišemo kot fizikalni ali mehanski proces, v katerem so koagulirani grudice ali kosmiči združeni, da tvorijo mase kot oblak in nato oborino.
Voda lahko vsebuje koloidne trdne snovi, kot so nerastopljive organske snovi, delci gline, bakterije, plankton, majhni delci razpadlega rastlinskega materiala itd. Tako se za ločevanje teh nečistoč iz vode uporabljajo tehnike koagulacije in flokulacije.
Koagulacijo dosežemo tako, da nevtraliziramo delce in s tem močno zmanjšamo odbojno silo med delci. Po postopku flokulacije koagulirani delci tvorijo veliko aglomeracijo, ki je znana tudi kot flok.
V flokulaciji so te aglomeracije destabiliziranih delcev v obliki velikih delcev. To lahko dosežemo tudi z dodajanjem visokomolekularnih organskih polimerov, topnih v vodi. Zaradi teh polimerov se velikost kosmičev poveča in nato se delci usedejo. Zelo pomembno je, da se flokulacijsko sredstvo rahlo premeša s počasno hitrostjo, tako da se lahko majhne kosmiči zlahka aglomerirajo v velike delce in se končno umirijo.
Za obdelavo vode koagulacijo običajno sledi flokulacija.
Tako se lahko z vidika čiščenja vode enostavno razlikujeta. Med koagulacijo se doda koagulant, ki združuje delce. Po drugi strani pa se med flokulacijo raztopina nežno meša, tako da se majhne grudice, ki nastanejo med koagulacijo, zberejo in tvorijo večje grudice. Ti veliki grudici se lahko umirijo in se tako lahko ločijo.