Ključna razlika: Glavna razlika med dvema celicama je, da prokariontske celice v bistvu nimajo jeder, medtem ko imajo evkariontske celice prave jedre. Eukariotske celice so večje in bolj kompleksne od prokariontskih celic.

Vse žive organizme je mogoče razvrstiti v eno od dveh skupin, odvisno od temeljne strukture njihovih celic. Dva glavna razreda celic sta prokarionti in evkarionti. Ti dve vrsti celic imata veliko skupnega. Opravljajo enake vrste funkcij in na enak način. Oba sta zajeta v plazemske membrane, napolnjene s citoplazmo, in napolnjene z majhnimi strukturami, imenovanimi ribosomi. Oba imata DNK, ki nosi arhivirana navodila za upravljanje celice. Vendar pa obstaja nekaj razlik med dvema tipoma celic.

Izraz prokariot je izpeljan iz grške besede "prokaryote", kar pomeni pred jedrom. Prokarioti so organizmi, sestavljeni iz celic, ki nimajo celičnega jedra ali katerih koli membransko obloženih organelov. To pomeni, da nimajo jedra. Tudi genetski material, tj. DNK v prokariotih, ni vezan znotraj jedra. Poleg tega je DNA manj strukturirana in je v eni zanki. Večina prokariotov je sestavljena iz ene same celice in se imenuje enocelični organizem. Obstaja tudi nekaj prokariotov, ki so narejeni iz zbirk celic in se imenujejo večcelični organizmi. Prokarioti so razdeljeni v dve skupini:

• Bakterije
• Archaea

Eukarioti so organizmi, sestavljeni iz celic, ki imajo membransko vezano jedro, kot tudi membransko vezane organele. Izraz evkariont izhaja iz grške besede eeukaryoteâ, kar pomeni resnične ali dobre jedre. Ta celica vključuje vsa življenjska kraljestva razen monera. Ti organizmi imajo genetski material v svojih celicah. Genetski material evkariontov je vsebovan v jedru v celici. DNA teh organizmov je strukturirana in organizirana v kromosome. Tudi DNA je linearna in je povezana z beljakovinami, da tvorijo kromatin. Eukariotski organizmi so lahko večcelični ali enocelični organizmi. Vse živali se obravnavajo kot evkarionti. Drugi evkarionti so rastline, glive in protisti.

Prokariontske in evkariontske celice so med seboj povezane v velikosti in kompleksnosti. Te celice se med seboj razlikujejo. Vendar pa so očitno bolj podobni kot različni in so jasno evolucijsko povezani med seboj. Biologi verjamejo, da je evkariontska celica jasno razvita iz prokariontske celice.

Primerjava med prokariontsko in evkariontsko celico:

	Prokariontska celica	Eukariotska celica
Opredelitev	To so organizmi, sestavljeni iz celic, ki nimajo celičnega jedra ali katerih koli membransko obloženih organelov.	Te organizme sestavljajo celice, ki imajo membrano vezano jedro, kot tudi membransko vezane organele.
Jedro	Nima jedra.	Ima pravo jedro, omejeno z dvojno membrano.
Razporeditev DNA	Ima krožno zanko.	To je linearno.
Velikost	Majhne celice (<5 µm)	Velike celice (<10 µm)
Celica	Vedno enocelični	Večinoma večcelični
Celične stene	Običajno prisotna; kemično kompleksna narava	Če je prisotna, je kemično preprosta
Beljakovine	V svoji DNK ne vsebuje beljakovin.	Vsebuje beljakovine v DNA, ki tvorijo kromatin.
Ribosom	Vsebuje majhne ribosome.	Vsebuje velike ribosome.
Citoplazma	Nobenega citoskeleta	Vedno imejte citoskelet
Delitev celic	Delitev celic je z binarno cepitvijo	Delitev celic je z mitozo
Razmnoževanje	Reprodukcija je vedno aseksualna	Reprodukcija je aseksualna ali spolna
Presnovne poti	Veliko različnih presnovnih poti	Pogoste presnovne poti
Flagella	Sestavljen iz dveh beljakovinskih gradnikov	Po naravi je kompleksna in je sestavljena iz več mikrotubulov
Večcelične oblike	Redko	Pogosti pri obsežni tvorbi tkiv
Mezosomi	Opravljajo funkcije golgi-teles in mitohondrijev ter pomagajo pri ločevanju kromosomov.	Ni prisoten
Plazemska membrana	Brez ogljikovih hidratov in pomanjkanja sterolov	Prisotni so steroli in ogljikovi hidrati
Glikokaliks	Prisotna je v obliki kapsule ali sluzi	Prisotni so v nekaterih celicah, ki nimajo celične stene
Primer	Bakterije in arheje	Živalske celice in rastlinske celice