Ključna razlika: Shia je ena od dveh glavnih sekt islama, druga pa suniti. Ismaili je delitev znotraj šiitske sekte. Delitev je posledica izbire imama.
Preden boste razumeli, kako se je šijata razdelila na te tri veje, je pomembno razumeti, kako so nastale razlike med suniti in šijiti. Pod Muhamedom so bili vsi muslimani obravnavani kot eni. Muhameda se šteje za končnega božjega preroka. Razlike so sledile Muhammedovi smrti. Muhammad je umrl brez uradnega razglasitve dediča, da vodi muslimansko skupnost. Dva glavna konkurenta sta bila Abu Bakr (Muhammadov oče) in Ali (Muhammadov bratranec in zet). Suniti so izbrali Abu Bakra, ki je bil prijatelj in zaupnik Muhameda kot kalifa, ki je vodil in svetoval. Vendar pa so šiiti verjeli, da bi moral kalifat ostati v družini Muhameda in zato raje izbrati Alija kot vodjo. Ali je postal četrti kalifat pod sunitsko vlado. Poleg tega obstajajo še druge majhne razlike glede tega, kako molijo in kaj verjamejo. Zaradi teh razlik med šijiti in suniti se stalno pojavljajo spopadi med dvema islamskima sektama.
Shia so se soočili tudi z nekaterimi notranjimi nesoglasji glede Imamov, ki bi morali voditi kot Imam. Pod šijitskim islamom se imama šteje za vodjo, za katerega se pričakuje, da ga vodi za vse vidike življenja. V skladu z Shia doktrino je Imama božanska institucija, ki je nasledila institucijo preroka. Verjamejo, da so imami izbrani in izbrani z božanskimi bitji, imajo popolno znanje in lahko pravilno razlagajo Qu'ran. Zdaj se razlika med Shia razlikuje zaradi izbire Imamov. Ismaili je podružnica šiitskega islama, ki je poimenovana po Ismailu ibn Ja'farju, za katerega verjamejo, da je upravičeno imenovan imam ali duhovni naslednik. To se razlikuje od Twelverjev, ki verjamejo, da je Mūsà al-Kāżim, mlajši brat Ismaila, kot pravi imam.
Izmailizem je bil na eni točki največja veja Shisima, ki je bil v desetem in dvanajstem stoletju v politični moči. Ker je ismalizem veja in del šijij, imata oba veliko prepričanj, vključno s tem, da obstaja samo en pravi Bog in da bi imami morali biti potomci Muhameda preko njegove hčerke Fatime. Tako Shias kot Ismaili verjamejo, da je družina Muḥammada (Ahl al-Bayt) kot božansko izbrana, nezmotljiva in vodena od Boga, da vodi islamsko skupnost.
Nizari Ismaili je pot (tariqah) šijitskega islama, ki poudarja socialno pravičnost, pluralizem in človeški razum v okviru mistične tradicije islama. Šteje se kot druga največja veja islama in tvori večino Ismailijcev. Mustaali Ismaili je sekta islamskega šiitskega islama. Glavna razlika med Nizari Ismaili in Mustaali Ismaili je, kdo bi moral voditi kot imam. Nizaris je sprejel Imam Nizar (prvi) kot devetnajstega imamja, medtem ko Mustaalis meni, da je mlajši brat Nizar Mustali. Nizarskih muslimanov trenutno vodi Aga Khan IV, ki je znan kot Imam Shah Karim.
Po Wikipediji je Musta'liyyah poimenovan tudi Taiyabi ali yayyibī, po zadnjem Imamu, ki ga priznavajo, yayyib Abī l-Qāṣim. Zgodovinsko je obstajala razlika med yayyibiyyah in iziāfiziyyah, pri čemer je slednji prepoznaval Fatimidske vladarje Egipta (med 1130–1169) kot legitimne Imame, in ne Ṭayyib Abī l-Qāṣim. Hafizski pogled je izgubil vso podporo po propadu dinastije Fatimid: današnja Musta'liyya so vse yayyibiyyah. Največja skupina Mustaali je Bohra, največja skupina Bohra pa je Dawoodi Bohra, ki jo najdemo predvsem v Indiji. Ime Bohra je reinterpretacija gudžaratske besede vahaurau ("trgovati"). Ljudje iz Bohre sestavljajo dve glavni skupini: večinoma trgovsko družbo in manjšino, ki je večinoma kmečki kmet. "
Shia in Ismaili sta precej podobni v svojih prepričanjih in kulturah, saj sta ismailija del šijitske sekte. Vse sekte imajo enako vero glede Allaha in Muhameda. Allah je verjel enemu in pravemu Bogu, saj je Muhamed zadnji Božji prerok.