Ključna razlika: Pinocitoza je absorpcija tekočin, medtem ko je fagocitoza absorpcija trdnih predmetov, ki so v bistvu hrana za celico.
Tako pinocitoza kot fagocitoza sta vrsti endocitoze. Endocitoza je proces, s katerim celice absorbirajo molekule, tako da jih absorbirajo. Te molekule pogosto vključujejo beljakovine in druge snovi, ki so pomembne za obstoj celice. Proces endocitoze uporabljajo vse celice, saj so molekule velike polarne molekule, ki ne morejo iti skozi hidrofobno plazmo ali celično membrano.
Pinocitoza je absorpcija tekočin, medtem ko je fagocitoza absorpcija trdnih predmetov, ki so v bistvu hrana za celico. Skoraj vse celice izvajajo pinocitozo, vendar fagocitozo izvajajo samo specializirane celice, ki ščitijo tkiva z bakterijami, celičnimi ostanki in drugimi nenormalnimi snovmi.
Pinocitoza je v bistvu proces absorpcije tekočine skupaj z njeno vsebino v celico. Celica to počne tako, da skozi membrano oblikuje ozke kanale. Ti kanali obkrožajo tekočino in vse njene vsebine, nato pa jo stisnejo v vezikule, zato se tekočina uspešno absorbira v celico. Nato se molekule zlivajo z lizosomi, da se hidrolizirajo ali razgradijo. Proces pinocytosis zahteva veliko energije v obliki adenozin trifosfata. To je kemična spojina, ki se običajno uporablja kot energija v večini celic.
Fagocitoza je proces absorpcije in zaužitja delcev v celici in številni protesti, kot je npr. Ameba za pridobivanje hranil. Proces absorpcije je podoben pinocitozi, le da je namesto tekočine absorbirana snov bistvena hranila, ki so obdana s kanalom in nato stisnjena v vezikule. Hranila se nato združijo z lizosomi in razgradijo z encimi. Vsak odpadni material se nato izloči iz celice.
Fagocitoza je sinonim za uživanje enoceličnih organizmov, vendar je pri večceličnih živalih ta proces prilagojen za odstranjevanje odpadkov in odpadkov, v nasprotju z zaužitjem hranil in goriva za celične procese. To še posebej velja za celice v imunskem sistemu, ki uporabljajo fagocitozo za odstranjevanje patogenov in drugih delcev celic, vključno z bakterijami, celicami mrtvih tkiv in majhnimi mineralnimi delci.
Snov, ki jo absorbira fagocitoza, je lahko tako velika kot celica, zaradi katere celica ustvarja vezikule, ki so dovolj velike, da obdajajo hranila. Pri pinocitozi pa so mehurčki veliko manjši, saj jih je potrebno le obkrožiti s tekočinami, ki nimajo posebne oblike. Tehnično, pinocytosis deluje kot fagocitoza, edina razlika je, da je fagocitoza specifična za snovi, ki jih prenaša. To je posledica dejstva, da fagocitoza zajema celice, ki jih kasneje razgrajujejo encimi in se absorbirajo v celice, medtem ko pinocitoza večinoma absorbira že raztopljeno ali razgrajeno hrano.