Ključna razlika: kuščarji so vrsta plazilcev, ki se pogosto pojavljajo v številnih različicah po svetu. Gekoni so specifične vrste kuščarjev, ki imajo široke prste in brez vek. Običajno jih najdemo v toplejših podnebjih.
Obstaja veliko različnih vrst kuščarjev, ki se razlikujejo od drugih. Pravzaprav obstaja več kot 6000 različnih vrst kuščarjev. Nekatere od teh, še posebej 1.650, so razvrščene kot geki. Obstajajo številni dejavniki, ki razlikujejo gecka od drugih kuščarjev.
Skoraj vsi kuščarji so hladnokrvni, imajo štiri noge in rep. Medtem ko ima večina kuščarjev suho in luskasto kožo, imajo grenki tanko kožo z majhnimi izboklinami. Poleg tega ima večina kuščarjev ponavadi noge, medtem ko imajo geki specializirano palico, ki se nagiba k površinam z uporabo naravne fizike. To jim omogoča, da se vzpenjajo gladke in vertikalne površine, kot so stene, okna in celo hodijo po stropu. Gekoni so prav tako ponavadi dvojni spoji, ki jim omogočajo, da odplaknejo noge s površine, na kateri so obtičali.